云南省中医医院脾胃病科始建于1992年，先后获批国家级重点专科传染病基地、脾胃病省级重点专科、国家GCP肝病专业、云南省中医脾胃病临床医学中心。作为云南省中医药学会脾胃病分会主委单位、云南女医师协会脾胃肝胆病专业分会主委单位、国家级"龙祖宏名医工作室"建设单位、云南中医药大学硕士学位授予点（肝病、脾胃病专业）建设单位，下设光华院区、滇池院区脾胃病科及消化内镜中心。近3年，专科充分发挥中医药特色，致力于功能性胃肠病、胃肠癌前病变、胃食管反流病的防治研究，建立规范化的中西医诊疗体系，各项医疗指标逐年提升，影响力逐步扩大，在临床、科研及教学等方面取得了较大的成绩。优势病种胃痛、胃痞、泄泻、便秘、食管瘅的诊疗方案及临床路径在云南省中医医疗集团多家医院脾胃病科推广应用。目前在研国家自然基金、国家级横向课题、省级重点、省部级科研、厅级科研10多项，发表代表性论文106篇，其中SCI 7篇、核心31篇、普通期刊68篇，主编论著7部，副主编2部，参编教材2部、论著7部。目前科室构建起一支以高层次人才为引领、中青年骨干人才为重点、临床与科研深度融合、结构合理的人才队伍。专科于2021年3月获批云南省中医（脾胃病）临床医学中心，获政府项目资金3000万；2023年8月牵头成立云南省中医医院脾胃病专科联盟。作为云南省中医脾胃病唯一的临床医学中心和云南省中医医院脾胃病专科联盟理事长单位，定期对基层医院开展医教研帮扶，充分发挥示范引领及辐射带动作用。